有效载荷运控中心紧密围绕空间应用任务，立足人工智能、大数据、虚拟现实、仿真分析、空间遥操作、机器人等专业技术，开展交叉学科综合应用技术研究，已突破了一系列相关领域的关键技术，搭建了第一代和第二代空间机械臂遥操作系统、沉浸式空间遥科学系统等等，为空间站科学实验任务和舱内机械臂遥操作任务提供技术支撑。有效载荷运控中心对航天相关的基础科学研究和应用十分重视，国家自然科学基金项目的获批表明本中心的创新研究、应用扩展及学科建设有了新的发展。